菅代表は小渕総理と小沢・自由党党首が連立政権樹立で合意したことについて、１９日の定例記者会見で「選挙で自民党政権打倒を唱えてきたかつての新進党、そして参院選挙における自由党が、どうもこのままでは選挙を戦えない、議席を確保できないということで、自民党に戻ろうという選択。まさに歴史を逆行させるもの」と批判した。また「そうなった場合には民主党は選挙協力など当然できない。民主党を中心とした連携の中で形で自民、自由連立政権に対峙していきたい。日本の民主主義の中で、政権交代のふたつの軸が明確になる」と述べた。